第10章　包 - 10.3 安装包 - 《学习R语言》

10.3 安装包

10.3 安装包

R出厂时被设置为访问CRAN的包库（提示选最近的镜像），如运行Windows则会访问CRANextra。CRANextra包含一些在Windows下构建时需特别注意的包，它们不能在通常的CRAN服务器上托管。要访问其他存储库，输入setRepositories ()，选择您想要的库。图10-2显示了它的可选项。

图像说明文字

图10-2：可用的包库列表

Bioconductor包含了与基因组学和分子生物学的包，而R-Forge和RForge.net大多包含了开发中的版本，它们最终出现会在CRAN。使用available.packages可以查看在库中的包的所有信息（请注意，因为那里的包有成千上万个，所以这需要好几秒钟运行）：

View(available.packages())

除了这些库，还能从网上很多其他的储存库中找到R的包文件，如GitHub、bitbucket和Google Code。正如下文所讨论的那样，从GitHub上取包特别容易。

许多IDE也提供了点选式的方法来安装包。在R的GUI中，在Package菜单中提供了“Install Package(s) …”的选项从资源库中安装包，以及使用“Install package(s) from local zip files…”来从你已下载的包中安装。图10-3显示R的GUI菜单。

图像说明文字

图10-3：使用R的GUI来安装包

你也可以使用install.packages函数来安装包。不使用任何参数将弹出同样的GUI界面，就像你点击了“Install package(s) …”菜单选项一样。通常你会想指定要安装的包的名字以及要访问的存储库的URL地址。在CRAN主站http://cran.r-project.org/mirrors.html上可以查到所有CRAN镜像的RUL列表。

此命令将（尝试）下载时间序列分析软件包xts、zoo和它们所有依赖的包，然后把它们安装到默认的库位置（.libPaths返回的第一个值）：

install.packages( 
  c("xts", "zoo"), 
  repos = "http://www.stats.bris.ac.uk/R/" 
)

如果想安装到不同的位置，把参数lib传递给install.packages：

install.packages( 
   c("xts", "zoo"),
   lib = "some/other/folder/to/install/to", 
   repos = "http://www.stats.bris.ac.uk/R/" 
)

很明显，你需要连上互联网才能使R下载包，而且你需要有把文件写入库目录的权限。在企业的内部网中，R的互联网访问可能会受限。在Windows下，你可以让R使用internet2.dll来访问因特网，就像使用IE浏览器一样来绕过访问限制。要做到这一点，请输入：

setInternet2()

如果以上的方法都不可行，访问http:// web/packages/available_packages_by_name.html并手动下载你所需的包（以及所有依赖包），然后安装这些tar.gz/tgz/zip文件：

install.packages( 
  "path/to/downloaded/file/xts_0.8-8.tar.gz", 
  repos = NULL,       # repo为NULL意味着包已经被下载 
  type = "source"     # 这意味着现在就构建包
) 
install.packages( 
  "path/to/downloaded/file/xts_0.8-8.zip", 
  repos = NULL,       # 还需要这个
  type = "win.binary" # 只是Windows! 
)

要直接从GitHub上安装包，你首先要安装devtools包：

install.packages("devtools")

install_github函数接受GitHub库的名称，此库将包含你所需要的包（通常与包本身的名称一样），以及维护此库的作者名。例如，要得到开发版本的reporting包knitr，输入：

library(devtools) 
install_github("knitr", "yihui")