10.4 其他软件包
对于研究的规划阶段,R还提供了不少其他有用的软件包。它们有的可能包含一般性的分析工具,而有的则可能是高度专业化的。
piface
包(见图10-4)提供了一个与R交互的Java图形用户界面(GUI),包含各种计算样本量的方法。该GUI允许用户交互性地修改研究的参数,观察它们对其他参数的影响。
图10-4 piface
项目的对话框示例
虽然该包仍在测试阶段,但是非常值得探究。在http://r-forge.r-project.org/projects/piface/上,可以下载piface
包的源代码和供Windows和Mac OS X使用的二进制文件。在R中,输入代码:
install.packages(“piface”, repos=”http://R-Forge.R-project.org”)
library(piface)
piface()
该包在探索样本大小、效应值、显著性水平和预期功效水平的改变对其他参数的影响时非常有用。
表10-4列出了其他与功效分析有关的软件包。最后5个包聚焦于基因研究中的功效分析。识别基因与可观测特征的关联性的研究称为全基因组关联研究(GWAS)。例如,它们可能关注为什么一些人会得某种特殊类型的心脏病。 表10-4 专业化的功效分析软件包
软 件 包 | 目 的 |
---|---|
asypow | 通过渐进似然比方法计算功效 |
PwrGSD | 组序列设计的功效分析 |
pamm | 混合模型中随机效应的功效分析 |
powerSurvEpi | 流行病研究的生存分析中功效和样本量的计算 |
powerpkg | 患病同胞配对法和TDT(Transmission Disequilibrium Test,传送不均衡检验)设计的功效分析 |
powerGWASinteraction | GWAS交互作用的功效计算 |
pedantics | 一些有助于种群基因研究功效分析的函数 |
gap | 一些病例队列研究设计中计算功效和样本量的函数 |
ssize.fdr | 微阵列实验中样本量的计算 |
最后,MBESS
包也包含了可供各种形式功效分析所用的函数。这些函数主要供行为学、教育学和社会科学的研究者使用。